Kategori
Uncategorized

Studi terbesar tentang varian HIV-1 di titik nol pandemi AIDS

Jurnal

Jurnal Scientific Reports telah menerbitkan studi terlengkap yang telah dilakukan hingga saat ini tentang varian HIV-1 yang beredar di antara anak-anak, remaja dan orang dewasa di Kinshasa, di Republik Demokratik Kongo, daerah yang dianggap sebagai asal pandemi. AIDS; dan yang dipimpin oleh peneliti Africa Holguín, dari Rumah Sakit Ramón y Cajal di Madrid dan CIBER of Epidemiology and Public Health (CIBERESP).

Para peneliti dari Laboratorium Epidemiologi Molekuler HIV dari Institut Penelitian Kesehatan (IRYCIS), yang bekerja di Layanan Mikrobiologi di Rumah Sakit Universitas Ramón y Cajal di Madrid, berpartisipasi dalam penelitian ini; Kelompok yang dipimpin oleh Juan Carlos Galán (CIBERESP), dari Laboratorium Virologi dari Layanan Rumah Sakit yang sama, Klinik Universitas Navarra dan Rumah Sakit Monkole di Kinshasa juga telah bekerjasama. Penelitian ini termasuk dalam program Imigrasi dan Kesehatan CIBERESP, di mana Holguín dan Galán berpartisipasi.

HIV-1

Bersama dengan rekan kerja mereka, para peneliti telah melakukan penelitian komprehensif yang menganalisis keragaman varian HIV-1 pada 2.806 anak, remaja dan dewasa dengan HIV di negara Afrika ini menggunakan rekonstruksi filogenetik. Untuk tujuan ini, mereka telah melakukan analisis bioinformatis pada semua urutan virus di wilayah pengkodean target terapeutik utama (wilayah pol virus) yang tersedia pada orang yang terinfeksi di negara itu.

virus baru

Ini termasuk urutan virus baru yang dihasilkan kelompok tersebut dari sampel darah kering baru yang diambil dari 165 orang yang terinfeksi di Kinshasa dalam beberapa tahun terakhir (2016-2018). Dengan demikian, penelitian ini memberikan data terbaru tentang varian HIV-1 di Republik Demokratik Kongo dan tren temporal mereka dari urutan pertama yang tersedia di negara yang diambil dalam sampel yang dipulihkan pada tahun 1976 hingga yang terakhir pada tahun 2018, serta di Kinshasa, ibukotanya, dari tahun 1983 hingga 2018. Peristiwa rekombinasi juga dianalisis dan kelompok penularan baru-baru ini diidentifikasi dalam kohort studi.

CIBERESP-IRYCIS

Menurut peneliti CIBERESP-IRYCIS Africa Holguín, “studi surveilans epidemiologi molekuler HIV-1 penting di seluruh dunia dan menarik dalam pengaturan apa pun. Tetapi mereka bahkan lebih menarik di daerah dengan keragaman virus yang tinggi, asal dari pandemi HIV-1, di mana virus telah beredar lebih lama dan varian baru yang lebih patogen atau dapat menular dapat muncul ”.

Lebih dari 133 varietas dijelaskan

Saat ini, lebih dari 133 varian HIV telah dideskripsikan berdasarkan homologi genetiknya, terbagi dalam tipe. Kelompok, subtipe, subtipe, dan circulating recombinants (CRF) dan unique (URF). Itulah sebabnya penelitian ini difokuskan pada studi distribusi temporal dari setiap varian. HIV-1 pada gen pol dan keragaman genetik virus di negara dan di Kinshasa dari awal pandemi hingga saat ini.

Untuk ini, varian virus dalam 165 urutan baru yang dihasilkan oleh tim kerja dari sampel darah kering yang diambil. Selama 2016-2018 di Kinshasa dibandingkan dengan varian yang diklasifikasikan ulang oleh tim. Peneliti dari semua urutan 2.641 pol yang disimpan di database Los Álamos oleh penulis lain sampai tanggal penelitian.

sampel pasien

Yang terakhir dikumpulkan dari sampel pasien HIV di Republik Demokratik Kongo selama 1976-2012 dan di Kinshasa selama 1983-2008. Varian virus di semua rangkaian HIV yang disimpan dalam database Los. Alamos sebelum 2016 telah diklasifikasikan sebelumnya dengan analisis filogenetik baru untuk memasukkan varian. HIV-1 baru yang diidentifikasi dalam beberapa tahun terakhir.

A, G dan C, subtipe yang paling banyak beredar

Selama periode 2016-2018, subtipe utama yang beredar di negara tersebut adalah A (26,7%), G (9,7%) dan C (7,3%). Rekombinan antara subtipe menyumbang sepertiga dari infeksi, dengan 12,7% CRF dan 23,6% URF (rekombinan yang lebih kompleks). Rekombinan CRF47_BF pertama yang dilaporkan di Afrika dan empat kelompok transmisi, 3 di antaranya baru-baru ini, diidentifikasi. Peningkatan yang signifikan pada subtipe A dan subtipe F1 juga diamati di. Kinshasa selama 2016-2018, serta penurunan yang signifikan pada subtipe. A1 dan subtipe D, dibandingkan dengan varian yang beredar di kota tersebut dari tahun 1983 hingga 2008.

Epidemiologi

Koordinator pekerjaan, Africa Holguín, menekankan bahwa “kami memberikan informasi yang unik dan terbaru tentang epidemiologi. Molekuler HIV-1 di Republik Demokratik Kongo, dan tentang varian. HIV-1 yang saat ini beredar di Kinshasa. Ini juga menyajikan tinjauan lengkap tentang tren temporal subtipe CRF dan. URF dan rekombinan di negara tersebut selama 43 tahun, memberikan data. Paling komprehensif tentang anak-anak dan remaja di seluruh sejarah epidemi di negara tersebut.

Peneliti CIBERESP menyimpulkan bahwa “penelitian kami memperkuat penggunaan darah kering sebagai jenis sampel yang. Berguna dan alternatif untuk darah utuh atau plasma dalam penelitian surveilans epidemiologi molekuler HIV di negara atau lingkungan. Dengan keterbatasan pengumpulan, penyimpanan atau pengangkutan. darah “.

Sumber : http://biotech-spain.com/es/articles/realizan-el-mayor-estudio-sobre-las-variantes-de-vih-1-en-la-zona-cero-de-la-pandemia-del-sida-/